水院位于郁金堂四合院之西部，由水院回廊、賞荷廳、四方亭、光華亭等建筑組成，中間一泓水名日觀魚池，水中植荷蓮，有磯石。1979年9月在磯石上置漢白玉莫愁女雕像，像高2.1米，重2噸，作采桑歸狀。水院回廊環(huán)水而建，串聯(lián)賞荷廳、四方亭、光華亭各建筑，面積139.53平方米，墻壁亦多石刻碑銘。光華亭居水院正南、磚木結(jié)構(gòu)，建筑面積68.99平方米，亭內(nèi)曾懸“月到風(fēng)來閣”匾，現(xiàn)不存，今木刻楹聯(lián)“憾江上石頭抵不住遷流塵夢柳枝何處桃葉無從轉(zhuǎn)羨他名將美人燕息能留千古跡，問湖邊月色照過來多少年華玉樹歌余金蓮無后收拾這殘山勝水鶯花猶是六朝春。”為曾廣照撰書。
四方亭居水院西北角，高二層，建筑面積42.34平方米，光緒十四年(1888)建，原為木結(jié)構(gòu)，1974年翻建，檐以下改為混合結(jié)構(gòu)，頂部仍為木結(jié)構(gòu)。《金陵古跡名勝》云：“曾云閣有角樓，聳臨湖上，登眺極佳”。賞荷廳居水院北首，共四間，面積118.84平方米，磚木結(jié)構(gòu)，墻壁亦有石刻碑銘。回廊有1981年林散之隸書“詩意”2字及草書：“盈盈一水莫愁湖，湖上佳人名姓盧。不愛綺情愛貞素，桑間陌上羨羅敷。石頭涼月曲如弓，六代繁華轉(zhuǎn)眼空。誰似莫愁湖上女，千秋沿溯小橋東”。錢松喦隸書“畫境”2字，費新我草書“相鄰一帶水，友誼萬年青”句，錢松喦隸書“莫愁何事卻多愁，愁逐春水不盡流。斬斷愁根湖勝昔，看花女伴笑揚州”句，劉海粟行書“莫愁湖邊千首詩，紫金山下萬株松”句。
魯迅1931年6月行書“雨花臺邊埋斷戟，莫愁湖里余微波。所思美人不可見，歸憶江天發(fā)浩歌”句。武中奇草書清馬士圖詩《柳絲織恨》：“憶昔采桑南陌頭，故鄉(xiāng)0-逐東流。回文欲倩重相識，風(fēng)挽情絲機上柔”。蕭嫻隸書明顧起元詩：“蕩漾平湖玉鏡光，群峰環(huán)帶畫螺長；酒人樓隱千波闊，溪女船回一水香。鷗夢不離捐釩渚，燕泥還上郁金堂。石城人去遺芳在，誰憶雙鴛向洛陽。”沙曼翁書元徐延徽文：“盡說盧家好莫愁，不知天上有牽牛。勝拋萬斛燕支水，溜向銀河一色秋”。懸掛全椒薛時雨同治辛未年題木刻楹聯(lián)：“勝跡訪鶯花料應(yīng)平地神仙得此處優(yōu)游湯沐，好山作屏障為問隔溪猿鳥是何人呼吸清涼”。